MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003210	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	16802049
2	NC_003210	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	16802049
3	NC_003210	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
4	NC_003210	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
5	NC_003210	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
6	NC_003210	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
7	NC_003210	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802049
8	NC_003210	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802049
9	NC_003210	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
10	NC_003210	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
11	NC_003210	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
12	NC_003210	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
13	NC_003210	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	16802049
14	NC_003210	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
15	NC_003210	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
16	NC_003210	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	16802049
17	NC_003210	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
18	NC_003210	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
19	NC_003210	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	16802049
20	NC_003210	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802049
21	NC_003210	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	16802049
22	NC_003210	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
23	NC_003210	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802049
24	NC_003210	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
25	NC_003210	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802049
26	NC_003210	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
27	NC_003210	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
28	NC_003210	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	16802049
29	NC_003210	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
30	NC_003210	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	16802049
31	NC_003210	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	16802049
32	NC_003210	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	16802049
33	NC_003210	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
34	NC_003210	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802049
35	NC_003210	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
36	NC_003210	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	16802049
37	NC_003210	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802049
38	NC_003210	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	16802049
39	NC_003210	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802050
40	NC_003210	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
41	NC_003210	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
42	NC_003210	AG	3	6	2073	2078	50 %	0 %	50 %	0 %	16802050
43	NC_003210	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802050
44	NC_003210	TCAA	2	8	2097	2104	50 %	25 %	0 %	25 %	16802050
45	NC_003210	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802050
46	NC_003210	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802050
47	NC_003210	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	16802050
48	NC_003210	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802050
49	NC_003210	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	16802050
50	NC_003210	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	16802050
51	NC_003210	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
52	NC_003210	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	16802050
53	NC_003210	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802050
54	NC_003210	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	16802050
55	NC_003210	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802050
56	NC_003210	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802050
57	NC_003210	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802050
58	NC_003210	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802050
59	NC_003210	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802050
60	NC_003210	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
61	NC_003210	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
62	NC_003210	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
63	NC_003210	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802051
64	NC_003210	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	16802051
65	NC_003210	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
66	NC_003210	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
67	NC_003210	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802051
68	NC_003210	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	16802051
69	NC_003210	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
70	NC_003210	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802051
71	NC_003210	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	16802051
72	NC_003210	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
73	NC_003210	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802051
74	NC_003210	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
75	NC_003210	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802051
76	NC_003210	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802051
77	NC_003210	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	16802051
78	NC_003210	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	16802051
79	NC_003210	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
80	NC_003210	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802051
81	NC_003210	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802051
82	NC_003210	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802051
83	NC_003210	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802051
84	NC_003210	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802051
85	NC_003210	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
86	NC_003210	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
87	NC_003210	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	16802051
88	NC_003210	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
89	NC_003210	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	16802051
90	NC_003210	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802051
91	NC_003210	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	16802051
92	NC_003210	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802051
93	NC_003210	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	16802052
94	NC_003210	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802052
95	NC_003210	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	16802053
96	NC_003210	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	16802053
97	NC_003210	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802053
98	NC_003210	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802053
99	NC_003210	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	16802053
100	NC_003210	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
101	NC_003210	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	16802053
102	NC_003210	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802053
103	NC_003210	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802053
104	NC_003210	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	16802053
105	NC_003210	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	16802053
106	NC_003210	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802053
107	NC_003210	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802053
108	NC_003210	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802053
109	NC_003210	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802053
110	NC_003210	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802053
111	NC_003210	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802053
112	NC_003210	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
113	NC_003210	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
114	NC_003210	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	16802053
115	NC_003210	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
116	NC_003210	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802054
117	NC_003210	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
118	NC_003210	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16802054
119	NC_003210	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	16802054
120	NC_003210	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
121	NC_003210	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
122	NC_003210	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802054
123	NC_003210	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
124	NC_003210	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
125	NC_003210	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
126	NC_003210	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
127	NC_003210	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
128	NC_003210	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	16802054
129	NC_003210	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802054
130	NC_003210	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	16802054
131	NC_003210	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
132	NC_003210	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802054
133	NC_003210	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
134	NC_003210	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802054
135	NC_003210	CG	3	6	6953	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	16802054
136	NC_003210	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802054
137	NC_003210	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
138	NC_003210	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802054
139	NC_003210	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	16802054
140	NC_003210	TAAA	2	8	7135	7142	75 %	25 %	0 %	0 %	16802054
141	NC_003210	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
142	NC_003210	A	7	7	7170	7176	100 %	0 %	0 %	0 %	16802054
143	NC_003210	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
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145	NC_003210	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802054
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148	NC_003210	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
149	NC_003210	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	16802054
150	NC_003210	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
151	NC_003210	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802054
152	NC_003210	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
153	NC_003210	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
154	NC_003210	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
155	NC_003210	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
156	NC_003210	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
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158	NC_003210	TAAA	2	8	8105	8112	75 %	25 %	0 %	0 %	16802055
159	NC_003210	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802055
160	NC_003210	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802055
161	NC_003210	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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163	NC_003210	A	6	6	8257	8262	100 %	0 %	0 %	0 %	16802055
164	NC_003210	GCA	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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167	NC_003210	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
168	NC_003210	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802055
169	NC_003210	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802055
170	NC_003210	AT	3	6	8697	8702	50 %	50 %	0 %	0 %	16802055
171	NC_003210	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
172	NC_003210	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
173	NC_003210	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
174	NC_003210	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
175	NC_003210	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
176	NC_003210	ATG	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
177	NC_003210	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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179	NC_003210	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802055
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181	NC_003210	AGT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
182	NC_003210	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
183	NC_003210	ATT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
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188	NC_003210	A	6	6	9377	9382	100 %	0 %	0 %	0 %	16802055
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192	NC_003210	TGA	3	9	9441	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
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200	NC_003210	GGT	2	6	9652	9657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802055
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250	NC_003210	AAT	2	6	12335	12340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802057
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252	NC_003210	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	16802057
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254	NC_003210	ATT	3	9	12513	12521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802057
255	NC_003210	TGA	2	6	12692	12697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802057
256	NC_003210	ATG	2	6	12721	12726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802057
257	NC_003210	AGT	2	6	13013	13018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802058
258	NC_003210	TTC	2	6	13055	13060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802058
259	NC_003210	T	7	7	13065	13071	0 %	100 %	0 %	0 %	16802058
260	NC_003210	GAT	2	6	13083	13088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802058
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262	NC_003210	CAA	2	6	13225	13230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802058
263	NC_003210	TA	3	6	13246	13251	50 %	50 %	0 %	0 %	16802058
264	NC_003210	A	6	6	13278	13283	100 %	0 %	0 %	0 %	16802058
265	NC_003210	TTA	2	6	13284	13289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802058
266	NC_003210	TGC	2	6	13301	13306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802058
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268	NC_003210	GTG	2	6	13333	13338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802058
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397	NC_003210	TGT	2	6	19868	19873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802063
398	NC_003210	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16802063
399	NC_003210	ATA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802064
400	NC_003210	GCA	2	6	19948	19953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802064
401	NC_003210	TTG	2	6	19985	19990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802064
402	NC_003210	GTT	2	6	20005	20010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802064
403	NC_003210	ACA	2	6	20053	20058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802064
404	NC_003210	TTA	2	6	20072	20077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802064
405	NC_003210	TTCA	2	8	20092	20099	25 %	50 %	0 %	25 %	16802064
406	NC_003210	GCA	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802064
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408	NC_003210	T	7	7	20303	20309	0 %	100 %	0 %	0 %	16802065
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